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能代山本医師会病院
能代市檜山にある一般社団法人能代市山本郡医師会が設置する地域医療支援病院。病床数は189床で、内科系・外科系の各科に加え、食道外科・乳腺外来・腫瘍内科・化学療法外来・もの忘れ外来などを持ち、救急外来やがん相談支援にも取り組んでいる。
医療法人弘仁会 島田病院
能代市西赤沼にある医療法人弘仁会の精神科単科病院。病床数は210床で、精神科病棟に加えて認知症治療病棟を持ち、外来診療と入院治療、精神科訪問看護を担う。作業療法や医療連携室による支援も行い、新規の受診は予約制となっている。
独立行政法人地域医療機能推進機構 秋田病院
能代市緑町にある独立行政法人地域医療機能推進機構（JCHO）の病院で、旧秋田社会保険病院。病床数は162床で、内科・外科・整形外科・小児科・産婦人科・泌尿器科・眼科・耳鼻咽喉科などを持ち、健康管理センターや訪問看護ステーション、病児保育室も運営している。