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独立行政法人国立病院機構 信州上田医療センター
上田市緑が丘にある独立行政法人国立病院機構の病院。病床数は420床で、内科・外科・小児科・産婦人科・整形外科・脳神経外科など幅広い診療科を持ち、がん治療や循環器病の救急医療、難病・周産期医療を担う地域がん診療連携拠点病院。
医療法人健救会柳澤病院
上田市中央西にある医療法人健救会の病院で、上田城跡公園の隣にある。病床数は98床で、一般病棟と医療型療養病棟を持ち、内科系の診療を中心に整形外科・外科・形成外科なども診る。人間ドックや訪問看護、デイケアなどの介護サービスも行う。
医療法人慈善会安藤病院
上田市中央西にある医療法人慈善会の病院。病床数は218床で、内科・外科・整形外科・精神科・心療内科・皮膚科を中心に診療し、物忘れ外来や心理カウンセリング外来、精神科訪問看護、訪問診療、グループホームの運営にも取り組んでいる。
医療法人健静会上田病院
上田市中央にある医療法人健静会の病院。病床数は72床で、内科・外科・整形外科・小児科・産婦人科・泌尿器科・皮膚科などを持ち、急性期から慢性期までの診療に加え、健診や予防接種、病児保育、介護サービスにも取り組んでいる。
医療法人友愛会千曲荘病院
上田市中央東にある医療法人友愛会の精神科病院。病床数は230床で、精神科・心療内科と内科を診療し、認知症疾患医療センターとして認知症の相談や診断にも対応する、地域のこころの医療を担う病院。
医療法人共和会塩田病院
上田市中野にある医療法人共和会の病院。病床数は47床で、内科・呼吸器内科・糖尿病内科・外科・小児科・整形外科を持ち、内視鏡検査や健診・人間ドックを行うほか、介護老人保健施設やグループホーム、訪問看護も運営している。
長野県厚生農業協同組合連合会 鹿教湯三才山リハビリテーションセンター 鹿教湯病院
長野県上田市鹿教湯温泉にある長野県厚生農業協同組合連合会（JA長野厚生連）の病院。病床数は475床で、鹿教湯三才山リハビリテーションセンターの中心として総合的なリハビリテーション医療を提供し、診療所や老健とも連携する。
丸子中央病院
長野県上田市中丸子にある社会医療法人丸山会の病院。病床数は199床で、一般病床・地域包括医療病棟・地域包括ケア病棟・医療療養病床を持つ。内科・外科・小児科・整形外科・精神科など幅広く診療し、介護医療院や病児保育も運営する。