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新潟県立精神医療センター
長岡市寿にある県立の精神科病院で、県の精神医療の基幹病院を担う。病床数は400床で、精神一般病床と児童青年期病床を持ち、精神科・児童精神科・内科・歯科を診療する。精神障害の予防から治療、デイケア、退院後の社会復帰の支援まで取り組んでいる。
長岡赤十字病院
長岡市千秋にある日本赤十字社の総合病院。病床数は554床で、内科系・外科系に小児科・新生児科・産婦人科・精神科・救急科などをそろえる。救命救急センターや総合周産期母子医療センターを持ち、がん診療連携拠点病院・基幹災害拠点病院でドクターヘリも運用する。
新潟県厚生農業協同組合連合会 長岡中央綜合病院
新潟県長岡市川崎町にある新潟県厚生農業協同組合連合会（JA厚生連）の総合病院。病床数は500床で、内科・外科・小児科・産婦人科・精神科・脳神経外科など幅広い診療科を持ち、がん診療連携拠点病院として地域の医療を担う。
長岡保養園
新潟県長岡市町田町にある特定医療法人至誠会の病院。昭和42年に精神科病院として開院し、のちに高齢者向けの病棟も設けた。病床数は148床で、精神科・内科・脳神経内科・リハビリテーション科を持ち、介護医療院や老健とも連携する。
吉田病院
新潟県長岡市長町にある医療法人誠心会の病院。昭和40年に外科医院として開設され、病床数は一般48床・療養77床の計125床。外科・内科・整形外科・消化器内科・リハビリなどを診療し、健診・人間ドックや訪問看護も行う。
立川綜合病院
新潟県長岡市旭岡にある社会医療法人立川メディカルセンターの総合病院。病床数は431床で、内科・外科・小児科・産婦人科・精神科・整形外科・脳神経外科など幅広い診療科を持ち、地域の中核病院として医療を担う。
悠遊健康村病院
新潟県長岡市日越にある社会医療法人立川メディカルセンターの病院。病床数は300床で、内科・循環器内科・呼吸器内科・整形外科・精神科・脳神経内科・リハビリテーション科などを持ち、同じ法人の立川綜合病院などと連携している。
長岡療育園
長岡市深沢町にある社会福祉法人長岡福祉協会の重症心身障害児（者）の療育施設で、1979年に開園した。病床数は165床で短期入所の床も含み、内科・小児科を診療する。療養介護・医療型障害児入所施設として入所や通園を受け入れ、地域療育支援にも取り組む。