レストラン・ミュージアムショップ

館内にレストラン「アクアクロス」とミュージアムショップ「ウミノス」がある。

参加体験・バックヤードツアー

釣りや調理の体験、飼育員による講座、普段は見られない裏側を巡るツアーなどを行う。

子ども体験館「アクアマリンえっぐ」

子どもが生き物に触れたり観察したりしながら学べる体験型の施設。

企画展

特定の生き物や海の環境をテーマにした期間限定の企画展を、常設展示とあわせて開く。

常設展示

「潮目の海」やサンゴ礁の海、北の海の海獣・海鳥、熱帯アジアの水辺など、海と川の環境ごとに生き物を展示する。