喫茶室・ミュージアムショップ

軽食をとれる喫茶室と、秋田に関する書籍やオリジナルグッズを扱うショップがある。

わくわくたんけん室・博物館教室

参加体験型の展示室で遊びながら学べるほか、講座やものづくりの教室を開く。

企画展・特別展

県内の資料を中心にした企画展や、県外・海外の資料も交えた特別展を年に数回開く。

菅江真澄資料センター・秋田の先覚記念室

江戸後期の紀行家・菅江真澄の記録や、近現代の秋田ゆかりの人物を紹介し、コーナー展も開く。

常設展示 (人文・自然展示室)

秋田の考古・歴史・民俗・工芸と、生き物や地質を2つの展示室で紹介する。