レストラン・ミュージアムショップ

1階にミュージアムレストラン「ル・サンク」があり、ミュージアムショップも併設する。

野外施設

菅生沼に面した広い敷地を散策でき、屋上からは沼や筑波山を見渡せる。

講座・体験イベント

自然や地学についての講座のほか、工作などの体験イベントを週末を中心に開いている。

企画展

地球科学や生物など、自然史の多様なテーマを取り上げる期間限定の展示を年に数回開く。

常設展示

マンモスと恐竜の骨格レプリカによるシンボル展示に始まり、宇宙・地球・生命の進化・茨城の自然などを展示室ごとにたどる。