レストラン・ミュージアムショップ

湖魚や近江米など滋賀の食材を使うレストランと、図録や琵琶湖にちなんだオリジナル商品を扱うショップ。

観察会・セミナー

学芸員による野外観察会や見学会、セミナーを開く。住民が参加する「はしかけ制度」などの活動もある。

ディスカバリールーム

子どもが標本にさわったりにおいをかいだりしながら、五感で発見を楽しめる体験型の部屋。大人向けの部屋もある。

水族展示

琵琶湖の固有種をはじめ、湖や川の生きものを生きた姿で観察できる水族展示室。

常設展示

A〜C展示室で、琵琶湖の生い立ちや湖と人の歴史、現在の自然と暮らしを化石や民具、実物大の再現展示で紹介する。