附属自然学習園

県の天然記念物・琵琶沼を中心とした湿原で、自然観察の場として公開している。

分館 教育資料館

国の重要文化財・旧山形師範学校本館の建物で、山形の教育のあゆみを紹介する。

博物館講座・展示解説会

年に数回の博物館講座や、国宝土偶「縄文の女神」などの展示解説会を行う。

企画展・特別展

特別展示室で、所蔵資料や調査研究をもとにしたテーマ展示を開く。

常設展示

山形の自然と恵み、考古から近世までの歴史、近代以降の暮らしの移り変わりを3つの展示室で紹介する。